Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EFHD1Q9BUP0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EFHD1Q9BUP0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms