Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COPS4Q9BT78 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COPS4Q9BT78 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms