Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RTKNQ9BST9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms