Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NICN1Q9BSH3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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