Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GINS3Q9BRX5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms