Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAPPC9Q96Q05 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms