Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJD4Q96KN9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJD4Q96KN9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms