Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP47Q96K76 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP47Q96K76 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms