Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HHIPL1Q96JK4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HHIPL1Q96JK4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms