Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK5RAP3Q96JB5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK5RAP3Q96JB5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms