Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG1Q96JA1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LRIG1Q96JA1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms