Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DDX11Q96FC9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DDX11Q96FC9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms