Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM3DQ96BQ1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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