Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMIGD2Q96BF3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMIGD2Q96BF3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms