Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM63Q969Q1 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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TRIM63Q969Q1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRIM63Q969Q1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms