Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DNAAF4Q8WXU2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DNAAF4Q8WXU2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms