Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATRIPQ8WXE1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms