Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PHIPQ8WWQ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms