Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C15orf40Q8WUR7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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C15orf40Q8WUR7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C15orf40Q8WUR7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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