Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MCOLN3Q8TDD5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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