Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DDX54Q8TDD1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX54Q8TDD1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms