Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIEQ8NEW7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TMIEQ8NEW7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms