Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMG8Q8ND04 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMG8Q8ND04 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms