Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC63Q8NA47 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC63Q8NA47 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms