Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMTC2Q8N394 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMTC2Q8N394 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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