Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC47Q8N1G4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC47Q8N1G4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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