Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC83Q8IWF9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms