Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXP4Q8IVH2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXP4Q8IVH2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms