Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37DQ86XT2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37DQ86XT2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms