Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NLRP9Q7RTR0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NLRP9Q7RTR0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms