Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SV2AQ7L0J3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SV2AQ7L0J3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms