Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A5Q71RS6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms