Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP50Q70EL3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms