Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms