Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC73Q6ZRK6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms