Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LRIG3Q6UXM1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms