Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC174Q6PII3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms