Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MED27Q6P2C8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED27Q6P2C8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms