Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms