Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RCSD1Q6JBY9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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RCSD1Q6JBY9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCSD1Q6JBY9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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