Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SDE2Q6IQ49 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SDE2Q6IQ49 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms