Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG9BQ674R7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG9BQ674R7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms