Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF3Q5VWG9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF3Q5VWG9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms