Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AGAP6Q5VW22 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms