Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GARNL3Q5VVW2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms