Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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GFI1BQ5VTD9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GFI1BQ5VTD9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GFI1BQ5VTD9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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