Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
L1TD1Q5T7N2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
L1TD1Q5T7N2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms