Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEND3Q5T5X7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms