Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
WDR44Q5JSH3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms