Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN4Q5BKX8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms